具体设计规则:

序列长度

合成PNA序列一般不超过18个碱基，这一长度不包括接头、氨基酸和标记物。

氨基酸的添加

可以在序列的N端或C端添加一个赖氨酸或半胱氨酸。

嘌呤含量

富含嘌呤的PNA容易发生聚合反应且水溶性差。因此，建议将嘌呤含量限制在60%以下。例如: GATTAGCAGTCTACG（可行-嘌呤含量<60%）。连续嘌呤的数量应不超过4个，而鸟嘌呤则不超过3个。例如: ATTAGGGGCATCTAC（不可行-连续4个G）CTAGATAGAAGGTTC（不可行-连续6个嘌呤）。如果无法避免，可以考虑探针互补链，例如: GTAGATGCCCCTAAT（可行-与上面序列的互补序列，未违背任何准则）GAACCTTCTATCTAG（可行-与上面序列的互补序列）。

避免自我互补序列

包括反向重复、发夹和回文序列。由于PNA/PNA间的相互作用强于PNA/DNA，这些类型的探针更易于聚合。四个碱基互补是可行的，但仅限于含有C和G碱基的情况。当它们被其他碱基间隔时也是可行的。例如: GATAATTGCA（可行-四个碱基互补）GATCCGGTAC（不可行-只有CCGG互补）TATCCTGGTA（可行，CC与GG之间间隔了一个碱基）。

此外，6个及以上碱基的互补性是不被允许的，例如: CTATTAATGCA（不可行-6个碱基互补）。然而，当它们被一个或多个碱基隔开时，6个碱基的互补是可行的，前提是不能仅含有C和G。例如: AGTGCTACT（可行-中间有间隔）GCGGCTCGC（不可行-仅包含G和C互补）。即使被一个或多个碱基间隔，8个碱基互补也是不可行的，例如: ACTGTCAGT（不可行-8个碱基互补）。

一般规则

强烈建议设计反向平行的PNA探针。PNA可以在任一方向形成双链，但反向平行取向形成更常见的双链。对反义和DNA探针类型应用而言，反向平行是最优先的构象。在反向平行取向下，PNA探针的N端对应于DNA的5’端。

PNA熔点

和DNA有所不同。由于PNA链是不带电的，PNA-DNA的Tm值通常比相应的DNA-DNA高。一般而言，在100 mM NaCl中，每增加一个碱基，Tm值会提高约1°C。在低盐浓度下，这种Tm值的差异更加明显。常见的，含有10个碱基的PNA，其Tm值约为50°C；含有15个碱基的PNA，其Tm值约为70°C。长度为12～17个碱基的PNA序列为最佳选择。

序列长度及影响

序列长度主要取决于具体应用。与DNA应用相比，PNA探针序列所需长度更短。较长的PNA链根据序列可能会倾向于聚合，因此在纯化和表征上较为困难。然而，序列越短，其特异性越强。因此，对于短序列来说，不匹配的影响会更显著。

订单信息

订购PNA的价格取决于序列长度、产量、纯度及修饰标记。请将您的具体需求发送至尊龙凯时(中国区)人生就是搏，我们将尽快与您联系。最低订购量为未标记PNA 20 nmole，标记PNA 10 nmole。我们提供90%和95%的纯度可供选择，并提供HPLC纯度分析和质谱分析报告。一般交货时间为2-3周；若为gamma PNA或修饰标记，交货时间为3-4周。

精选引用

想了解使用我们PNA的已发表研究文献吗？
1. Exponential Increase in an Ionic Signal: A Dominant Role of the Space Charge Effect on the Outer Surface of Nanochannels. Anal Chem | 28 Sep 2021. All single-stranded PNA sequences were purchased from SBS Genetech Co., Ltd. (Beijing, China).
2. Peptide Nucleic Acid-Functionalized Nanochannel Biosensor for the Highly Sensitive Detection of Tumor Exosomal MicroRNA. Anal Chem | 30 July 2021. PNA was synthesized by SBS Genetech Co., Ltd. (Beijing, China).
3. Ultrasensitive Exosomal MicroRNA Detection with a Supercharged DNA Framework Nanolabel. Anal Chem | 2 April 2021. Thiolated PNA with a −(CH2)6− spacer at the 5′ end was synthesized and purified by SBS Genetech Co., Ltd. (Beijing, China).